Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM5

Rnd2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd2Q9QYM5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnd2Q9QYM5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnd2Q9QYM5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnd2Q9QYM5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnd2Q9QYM5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms