Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm40Q9QYA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tomm40Q9QYA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms