Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms