Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk1nQ9QXV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcsk1nQ9QXV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk1nQ9QXV0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms