Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc2lQ9JME7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2lQ9JME7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms