Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gkap1Q9JMB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gkap1Q9JMB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkap1Q9JMB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms