Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf23Q9JLR5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcf23Q9JLR5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcf23Q9JLR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf23Q9JLR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf23Q9JLR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms