Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prg3Q9JL95 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prg3Q9JL95 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prg3Q9JL95 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prg3Q9JL95 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prg3Q9JL95 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms