Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK38

Gnpnat1, Glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpnat1Q9JK38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnpnat1Q9JK38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnpnat1Q9JK38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnpnat1Q9JK38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gnpnat1Q9JK38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpnat1Q9JK38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gnpnat1Q9JK38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gnpnat1Q9JK38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpnat1Q9JK38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpnat1Q9JK38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpnat1Q9JK38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpnat1Q9JK38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gnpnat1Q9JK38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms