Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r3cQ9JK24 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r3cQ9JK24 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r3cQ9JK24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r3cQ9JK24 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms