Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng3Q9JJV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacng3Q9JJV5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng3Q9JJV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng3Q9JJV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng3Q9JJV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms