Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bgrlQ9JJU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bgrlQ9JJU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bgrlQ9JJU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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