Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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Bco1Q9JJS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Bco1Q9JJS6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco1Q9JJS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Bco1Q9JJS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Bco1Q9JJS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco1Q9JJS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco1Q9JJS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Bco1Q9JJS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco1Q9JJS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Bco1Q9JJS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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Bco1Q9JJS6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Bco1Q9JJS6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Bco1Q9JJS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco1Q9JJS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms