Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Akip1Q9JJR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Akip1Q9JJR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akip1Q9JJR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Akip1Q9JJR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akip1Q9JJR5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms