Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LratQ9JI60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LratQ9JI60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LratQ9JI60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LratQ9JI60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LratQ9JI60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms