Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn1Q9EPL2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clstn1Q9EPL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clstn1Q9EPL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms