Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r50Q9EP51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r50Q9EP51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r50Q9EP51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r50Q9EP51 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms