Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan4Q9DCK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan4Q9DCK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan4Q9DCK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan4Q9DCK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms