Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SelenooQ9DBC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelenooQ9DBC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SelenooQ9DBC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelenooQ9DBC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms