Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift43Q9DA69 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ift43Q9DA69 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift43Q9DA69 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift43Q9DA69 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms