Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efhc1Q9D9T8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Efhc1Q9D9T8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efhc1Q9D9T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhc1Q9D9T8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efhc1Q9D9T8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhc1Q9D9T8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efhc1Q9D9T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms