Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms