Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2e2Q9D902 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e2Q9D902 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2e2Q9D902 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms