Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Arfgap3Q9D8S3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfgap3Q9D8S3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgap3Q9D8S3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgap3Q9D8S3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms