Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D8Q6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8Q6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms