Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl4Q9D8E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl4Q9D8E6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl4Q9D8E6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl4Q9D8E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms