Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c55Q9D816 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp2c55Q9D816 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp2c55Q9D816 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp2c55Q9D816 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms