Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf225Q9D7D1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf225Q9D7D1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf225Q9D7D1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf225Q9D7D1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms