Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tube1Q9D6T1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tube1Q9D6T1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tube1Q9D6T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tube1Q9D6T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms