Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9bQ9D6E4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc9bQ9D6E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc9bQ9D6E4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9bQ9D6E4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms