Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hrct1Q9D6B9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hrct1Q9D6B9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms