Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp4Q9D4F8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp4Q9D4F8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms