Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430402E10RikQ9D3N5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5430402E10RikQ9D3N5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430402E10RikQ9D3N5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
5430402E10RikQ9D3N5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms