Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc8Q9D2H8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fndc8Q9D2H8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc8Q9D2H8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc8Q9D2H8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms