Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mrpl28Q9D1B9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl28Q9D1B9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms