Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem53Q9D0Z3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem53Q9D0Z3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem53Q9D0Z3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem53Q9D0Z3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms