Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FopnlQ9CZS3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FopnlQ9CZS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FopnlQ9CZS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FopnlQ9CZS3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FopnlQ9CZS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms