Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrps28Q9CY16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrps28Q9CY16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrps28Q9CY16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrps28Q9CY16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrps28Q9CY16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrps28Q9CY16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrps28Q9CY16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrps28Q9CY16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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