Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms