Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6kQ9CWP4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly6kQ9CWP4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6kQ9CWP4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ly6kQ9CWP4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6kQ9CWP4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6kQ9CWP4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6kQ9CWP4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6kQ9CWP4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms