Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BccipQ9CWI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BccipQ9CWI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BccipQ9CWI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms