Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldnd1Q9CQX5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldnd1Q9CQX5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldnd1Q9CQX5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldnd1Q9CQX5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms