Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX3

Bpifa5, BPI fold-containing family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa5Q9CQX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bpifa5Q9CQX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa5Q9CQX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bpifa5Q9CQX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bpifa5Q9CQX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms