Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otub2Q9CQX0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otub2Q9CQX0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otub2Q9CQX0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otub2Q9CQX0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms