Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Txndc9Q9CQ79 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Txndc9Q9CQ79 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Txndc9Q9CQ79 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txndc9Q9CQ79 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms