Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NepnQ9CQ76 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NepnQ9CQ76 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NepnQ9CQ76 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NepnQ9CQ76 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NepnQ9CQ76 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NepnQ9CQ76 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NepnQ9CQ76 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NepnQ9CQ76 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms