Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930550L24RikQ99PA7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
4930550L24RikQ99PA7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930550L24RikQ99PA7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms