Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pcgf6Q99NA9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcgf6Q99NA9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcgf6Q99NA9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcgf6Q99NA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pcgf6Q99NA9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms