Protein–RNA interactions for Protein: Q99N42

Tymp, Thymidine phosphorylase, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TympQ99N42 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TympQ99N42 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TympQ99N42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TympQ99N42 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TympQ99N42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TympQ99N42 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TympQ99N42 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TympQ99N42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TympQ99N42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TympQ99N42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TympQ99N42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TympQ99N42 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms