Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm2d1Q99MB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm2d1Q99MB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm2d1Q99MB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms