Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rwdd2bQ99M03 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rwdd2bQ99M03 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rwdd2bQ99M03 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms